人脑胶质瘤预后相关基因模型的建立与验证
CSTR:
作者:
作者单位:

作者简介:

通讯作者:

中图分类号:

R739.41

基金项目:

广西自然科学基金(2018GXNSFAA050115);


Author:
Affiliation:

Fund Project:

  • 摘要
  • |
  • 图/表
  • |
  • 访问统计
  • |
  • 参考文献
  • |
  • 相似文献
  • |
  • 引证文献
  • |
  • 资源附件
  • |
    摘要:

    目的:通过生物信息学分析方法筛选人脑胶质瘤预后不良相关基因,分析预后基因模型在人脑胶质瘤预后预测中的价值。方法:分别从GTEx数据库、TCGA数据库中下载正常人大脑皮层测序数据、人脑胶质瘤(胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤)相关转录组测序数据和患者生存资料,验证集CGGA325和CGGA693测序数据来源于CGGA数据库,从人脑胶质瘤和正常人大脑皮层测序数据之间筛选出差异表达基因,对其进行单因素Cox回归、Lasso回归和CGGA325和CGGA693生存分析验证;筛选与人脑胶质瘤患者生存密切相关的基因,分析高、低风险评分预后基因模型对脑胶质瘤患者总生存期的影响;ROC曲线评估预后模型预测脑胶质瘤患者总生存期的价值。结果:在TCGA中,共筛选出12 709个差异表达基因,其中表达上调的基因7 120个,表达下调的基因5 589个,经单因素Cox、Lasso回归分析结合验证集CGGA325和CGGA693生存分析验证,最终确定DDX47、DIABLO、GABARAP、SMARCE1、ZNF410均与脑胶质瘤患者预后相关(P<0.05),在TCGA中,高风险评分预后模型(DDX47+DIABLO+GABARAP+SMARCE1+ZNF410)组患者的预后较低风险评分组差(P<0.05),预后模型预测脑胶质瘤患者1年、3年和5年总生存期的曲线下面积(AUC)分别为0.779、0.750和0.742;在验证集CGGA325和CGGA693中,预后模型高风险评分组患者的预后均较低风险评分组差(P<0.05),预后模型在CGGA325中预测脑胶质瘤患者1、3和5年总生存期的AUC分别为0.673、0.778和0.830,在CGGA693中预测脑胶质瘤患者1、3和5年总生存期的AUC分别为0.680、0.700和0.709。结论:DDX47、DIABLO、GABARAP、SMARCE1和ZNF410可能为脑胶质瘤患者生存相关基因,具有作为人脑胶质瘤预后分子标志物的潜能,高风险评分预后模型(DDX47+DIABLO+GABARAP+SMARCE1+ZNF410)与患者预后不良相关,且对预测患者3、5年总生存期具有潜在价值。

    Abstract:

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

何思远;覃玉娟;甘光磊;吴永明;李光景;宋健;.人脑胶质瘤预后相关基因模型的建立与验证[J].川北医学院学报,2024,39(4):433-438.

复制
分享
相关视频

文章指标
  • 点击次数:
  • 下载次数:
  • HTML阅读次数:
  • 引用次数:
历史
  • 收稿日期:
  • 最后修改日期:
  • 录用日期:
  • 在线发布日期: 2025-08-20
  • 出版日期:
文章二维码