目的:探讨4例46,XY性发育障碍发生的分子机制。方法:收集患者临床病历资料，采集其肝素抗凝外周血进行淋巴细胞培养，染色体G显带技术制备并分析染色体核型，提取外周血DNA行SRY基因检测和测序，SRY基因检测结果阴性者外送标本行性发育相关基因靶向测序，生物信息学方法分析测序结果。结果:查体显示4例患者社会性别均为女性，而外周血淋巴细胞核型分析结果提示核型均为男性(46,XY),社会性别与生物学性别不一致；性别决定基因SRY均为阳性，测序结果提示病例1为SRY基因编码区第5位碱基缺失(c.del5A),病例2为SRY基因编码区第5位碱基发生错义突变(c.5A>T),病例3为SRY基因编码区第6位碱基缺失(c.del6A),病例4的SRY基因检测范围内未见突变位点，靶向测序结果提示雄激素受体基因(AR)编码区发生错义突变(c.2117 A>G);生物信息学软件Mutation taster提示c.del5A、c.del6A和c.2117 A>G等3种突变可能导致疾病发生，c.5A>T突变可能为人群多态现象；Raptor X蛋白质三维结构预测软件分析结果显示SRY基因c.5A>T突变对SRY蛋白的三维构象没有影响，而AR基因c.2117 A>G突变可导致AR蛋白的三维结构明显变化，并增加两个氢键；PolyPhen-2显示SRY基因c.5A>T和AR基因c.2117A>G突变为可能致病；ClinvAR软件分析结果提示4种突变均未见临床病例报道。结论:基因突变可能是导致患者性器官发育异常的原因，基因检测有助于明确诊断以及家庭再生育咨询。