目的:探讨基于加权共表达网络分析，用免疫组织化学法对其结果进行验证，分析枢纽基因HOXB9在下咽癌中的作用。方法:根据TCGA的数据，确定了3 496个头颈鳞状细胞癌(HNSCC)和正常样本之间差异表达的基因；选择这些差异基因进行富集分析及加权基因共表达网络分析(WGCNA)确定HNSCC患者临床特征相关的基因模块；随后对其中的枢纽模块进行预后生存分析发现关键基因；对关键基因进行免疫组织验证。结果:数据分析得出肿瘤中的差异表达基因及关键基因模块；关键模块基因的预后生存分析发现11个关键基因；通过免疫组化验证HOXB9,证实HOXB9在下咽癌中表达水平明显上调(P<0.05)。结论:HOXB9在下咽癌肿瘤中明显高表达，且可能与肿瘤分期及淋巴结转移相关，这可能成为下咽癌潜在的预后标志物及治疗靶点。